De acuerdo a los lineamientos institucionales establecidos, y en colaboración con el Ministerio de Salud de la Nación y el Ministerio de Relaciones Exteriores y Culto, la ANMAT coopera activamente con las agencias de los países de la región y del resto del mundo.

A través de diferentes instrumentos jurídicos, la ANMAT formaliza sus acciones y propone líneas de trabajo específicas con sus contrapartes.